Elitarna jednostka G.I. Joe zostaje zdradzona i uznana za wroga państwa. Ocalali żołnierze muszą działać w ukryciu, by oczyścić swoje imię i powstrzymać globalne zagrożenie.
Podczas rutynowej misji oddział G.I. Joe wpada w zasadzkę i zostaje niemal całkowicie zlikwidowany. Za atakiem stoi organizacja Kobra, która przejęła kontrolę nad strukturami władzy i oskarża jednostkę o zdradę stanu. Nieliczni ocaleni, dowodzeni przez Roadblocka, rozpoczynają walkę z potężnym wrogiem, działając poza oficjalnymi kanałami. W misji wspiera ich generał Joe Colton, legendarny twórca formacji. Film jest bezpośrednią kontynuacją „G.I. Joe: Czas Kobry” z 2009 roku, wyreżyserowaną przez Jona M. Chu, z udziałem m.in. Dwayne’a Johnsona i Bruce’a Willisa.
Film jest dostępny online w serwisie VOD player.pl.